Auf der Brücke des Flaggschiffs brach Elizabeth eine der Flöten aus dem Alarmstatuen des Songbird Verteidigungssystems und spielte darauf die Melodie, die ihr Booker von ihrem älterem Selbst gab. Wie verheißen, zähmten die Töne den Vogel. Wenige Augenblicke später zerriss er auf ihr Kommando die letzten Überbleibsel der Engelsstatue von Monument Island. Doch die weiß-blaue Entladung der Explosion zerstörte ebenso die Flöte und eine Sekunde später raste Songbird bereits wieder auf sie zu. Booker fürchtete bereits das Schlimmste. Aber Elizabeth war endlich frei. Nichts hielt ihre Kräfte mehr zurück. Mit einer schlichten Handbewegung teleportierte sie sich und Booker nach Rapture. Songbird folgte ihnen, jedoch auf der falschen Seite des Glases. Der mechanische Vogel wurde innerhalb weniger Sekunden vom extremen Druck der Meerestiefe zerdrückt. Mit einer Tauchkugel entfloh das Duo der Unterwasserstadt und schritt durch die Tür, des an der Oberfläche thronenden Leuchtturms.
Ohne ihre Fesseln blickte Elizabeth in alle möglichen Realitäten gleichzeitig. Columbia oder Rapture. Compstock oder Ryan. Es waren Konstanten und Variablen eines endlosen Mulitversums. In jedem gab es einen Leuchtturm, eine Stadt und einen Herrscher. Es variierte lediglich, ob es Columbia, Rapture oder eine ganz andere Stadt war und wer diese regierte. Sie veranschaulichte es Booker anhand eines Reiches zwischen den Realitäten. Wo jede mögliche Variation durch einen anderen Leuchtturm repräsentiert wurde.
Einer der Leuchttürme führte die beiden zurück an den Punkt, wo alles begann. Zu Booker DeWitts Taufe nach dem Wounded Knee Massaker. Seine Entscheidung in dem Augenblick bestimmte den Verlauf seines folgenden Lebens. Er, Booker DeWitt, lehnte die Taufe damals im letzten Moment ab, weil er glaubte, diese Geste könnte seinen Sünden nicht reinwaschen. Zwei Jahre später gebar seine Frau Annabelle ihm eine Tochter. Verstarb jedoch bei der Geburt. In Gedenken an sie nannte er das Baby Anna.
Zeitgleich experimentierte Rosalind in Comstocks Universum weiter mit den Quantenpartikeln und erschuf ein Lutece Feld. Durch dieses schloss sie sich mit ihrem Gegenstück in Bookers Universum kurz. Was eine männliche Variation namens Robert Lutece war. Zachary Comstock nutzte die Lutece Felder in den folgenden Monaten, u.a. um in die Zukunft zu blicken. Wodurch er Columbias düstere Wahrheit eines fehlenden Nachkommens erkannte. Da er durch selbige Observation der Risse jedoch steril wurde, schlug Rosalind vor, schlichtweg das Baby aus Roberts Universum zu holen. Booker stürzte sich nach dem Tod seiner Frau in Alkohol und Spielschulden. Weshalb er schnell auf Robert Luteces Angebot einging, diese im Austausch für die kleine Anna zu tilgen. Aber in der letzten Sekunde, als Robert bereits durch den Tear gestiegen war und Comstock sie hindurch trug, überlegte Booker es sich anders. Er zerrte an Comstocks Arm und hielt Anna dadurch für einen winzigen Augenblick zurück. Der sich schließende Tear trennte den kleinen Finger ihrer ausgestreckten Hand ab. Deshalb wuchs Elizabeth mit dem Stummel heran. Denn sie war Anna, Bookers leibliche Tochter. Der Finger in dem einen Universum und der Rest ihres Körpers in einem anderen ließ die kleine Elizabeth später ihre quantenmechanischen Kräfte entwickeln. Als ewige Erinnerung an diesen Fehler, ritzte Booker sich die Initialen seiner Tochter in die Hand: AD.
20 Jahre später, überzeugten die mittlerweile allgegenwärtigen Lutece Zwillinge Booker, seine eigene Tochter von Comstock zurück zu holen. Doch seine Reise durch den Tear und die verschiedenen Erinnerungen der Realitäten kollidierten. Wodurch Booker seinen aktuellen Auftrag mit dem ersten verwechselte und glaubte, Elizabeth im Austausch für seine Schulden befreien zu müssen.
Nun, wo der Kreislauf geschlossen war, glaubte Booker, er könne endlich das Leben zusammen mit seiner Tochter Elizabeth genießen. Aber sie machte ihm klar, dass alles endlos seinen Lauf nehmen würde, so lange Comstock in einem der Universen überlebte. Die einzige Möglichkeit Comstock auszulöschen, wäre bevor sämtliche Variationen entstanden. Er müsse bei seiner Geburt getötet werden. Also führte Elizabeth Booker erneut zur Taufe. Denn der Booker DeWitt, der damals nicht ablehnte, wurde Zachary Comstock getauft. Statt Alkoholismus und Spielsucht gedieh er zum Schöpfer Columbias und setzte alles in Gang. Während Booker das realisierte, versammelten sich verschiedene Variationen Elizabeth aus unzähligen Universen um ihn und drückten ihn unter Wasser. Booker verstand, dass es keine andere Lösung gab und ließ es zu.