Episode 2
Obwohl die Wagons Getränkedosen in einem Pfandautomaten glichen, überstanden Alyx und Gordon das Unglück unversehrt. Die 24-jährige kroch zuerst aus den Trümmern. Gerade als sie Gordon befreite, zeichnete sich das volle Ausmaß der Combine Manipulation ab. Das katalytische Quantenereignis verwandelte den Zitadellen-Reaktor in die Vorstufe eines Super-Portals! Mehr und mehr Energie aus den Reaktor-Überresten aufsaugend, würde der blaue Strudel in wenigen Stunden die Dimensionen verschmelzen lassen und die Erde somit erneut dem Combine-Armeen ausliefern. Einen Vorgeschmack darauf erhielten Alyx und Gordon bereits durch einen Portal-Sturm. Die über sie hinwegfegende blaue Schockwelle generierte neue Tore, durch welche Außerirdische einfielen. Der Sieben-Stunden-Krieg fing buchstäblich von Vorne.
Verfolgt von dreibeinigen und fliegenden Jägern des Combine, erreichten Alyx und Gordon Minuten später eine alte Kommunikationsanlage. Von dort aus kontaktierten sie das White Forest Raketensilo nördlich der Stadt. Alyx Schilderungen der immensen Datenströme folgend, kombinierte Doktor Isaac Kleiner, das heruntergeladene Datenpaket müsse den Portal-Code des Combines enthalten. Gewissermaßen die interdimensionale Anschrift der Combine-Welt. Eine lebenswichtige Komponente für die Außerirdischen sowie den Widerstand. Vor der Auslöschung der Zitadelle hätte das Combine sämtliche Sabotageversuche umgehend gekontert. Aber jetzt könnte die Widerstandsgruppe damit eine Rakete in den Orbit schießen, dort eine Verbindung zum alten Satellitennetz aufbauen und mit deren Xenium Resonator das Super-Portal neutralisieren. Nur musste das Datenpaket dafür zunächst White Forest erreichen und die vorübergehende Verbindung brach genau in dem Moment ab.
Sich zu Fuß weiter durch den Wald vorarbeitend, überraschte ein weiterer Combine Jäger Alyx ausgerechnet, als die beiden in einer alten Minenanlage kurz getrennt waren. Der biomechanische Dreibeiner sprang der jungen Frau in den Rücken, warf sie dadurch zu Boden und durchbohrte dann ihren Oberkörper mit seinen beiden giftigen Klauen. Gordon versuchte ihr zur Hilfe zu eilen, aber der folgende Tritt des Jägers ließ die Betonkonstruktion über dem Wissenschaftler einstürzen. Getroffen vom Geröll kam Gordon gerade wieder zu sich, als ein Ameisenlöwe versuchte über Alyx herzufallen. Glücklicherweise hinderte ihn ein Vortigaunt in letzter Sekunde daran. Zwar schlug dieser sämtliche Angreifer zurück und befreite ebenso Gordon aus seiner misslichen Lage, doch schwand das Leben da bereits aus Alyx Körper. Viel mehr als eine kurzzeitige Stabilisierung vermochte der Vortigaunt alleine nicht zu vollbringen.
Selbst unterstützt von dreien seiner Gefährten, stellten die zertrümmerten Knochen, die Vergiftung und der Blutverlust eine immense Herausforderung da. Erst nachdem Gordon Larvenextrakt aus einem der Ameisenlöwennester beschaffte, gelang es dem Quartett mit ihrer gemeinsamen Verbindung zur Vortessence Alyx zu heilen. Derart vertieft in ihr Werk, bemerkten die Vortigaunts ausnahmsweise nicht die erneute Einmischung des Anzugträgers. Zwei Dekaden zuvor half er Eli, seine Tochter aus dem Black Mesa Komplex zu schaffen. Ein instrumentaler Dienst für die Zukunft der Menschheit, in dem dessen Auftraggeber damals keinen Nutzen sahen. Als Einziger erkannte der Anzugträger zu der Zeit bereits Alyx Potential. Welches er zwischenzeitlich noch weitaus größer einschätzte. Gewissermaßen als Wiedergutmachung für seine Vorangegangenen Rettungen Gordons, forderte er nun vom Brechstangenschwinger ein, Alyx sicher nach White Forest zu geleiten. Denn die Drahtzieher von allem untersagten dem Anzugträger, selbst stärker ins Geschehen einzugreifen. Im Anschluss an diese Bitte, wandte die Gestalt sich Alyx persönlich zu. Er bat sie, ihrem Vater eine Botschaft zu überbringen: Bereite dich auf unvorhergesehene Konsequenzen vor.
Kaum flüsterte er diese Worte ins Ohr, erlangte Alyx das Bewusstsein zurück. Noch erschöpft, aber fest entschlossen, schritt sie sogleich Richtung Fahrstuhl, um ihrem Vater die Botschaft zu überbringen.
Beim Aufstieg aus dem Stollenkomplex, machten die Verbündeten eine erschreckende Entdeckung. Die nahegelegene Talbrücke überzog eine Armada der außerirdischen Besetzer. Beginnend mit Stridern bis hin zu Beratern in ihren Brutkammern. Was auch immer vom Combine in Osteuropa übrig blieb, marschierte aktuell gen Norden. Eine Richtung in der sowohl das Alternativportal der Borealis als auch White Forest lagen. Alyx beängstigte diese Erkenntnis deutlich mehr als Gordon. Denn ohne Vorwarnung würde diese Armee ihren Vater und die gesamte Widerstandsgruppe von White Forest problemlos auslöschen. Ihren Instinkten folgend, erreichte sie mit Gordon wenige Minuten darauf einen Funkturm und kontaktierte das Raketensilo. Doktor Arne Magnusson, Isaacs einstiger Rivale von Black Mesa, beantwortete Alyx Funkspruch. Bedauerlicherweise ließ er die junge Frau kaum zu Wort kommen und so riss die Verbindung unter den Angriffen des Combine ab, bevor Alyx ihre Warnung aussprach.