Ernesto Victoriano, Rubens Vater, schämte sich für seinen durchs Feuern entstellten Sohn. Er sperrte ihn in den Keller und erzählte seiner Frau, beide Kinder wären beim Scheunenbrand ums Leben gekommen. Verstört, vom Tod seiner Schwester und der Behandlung seines Vaters, brachte Ruben seine Eltern eines Nachts im Schlaf um. Er flüchtete sich fortan in die Wissenschaft. Genauer gesagt die Psychotherapie. Ruben fing an die Köpfe von Tieren zu sezieren und ließ seine sadistischen Züge dann an den Gehirnen noch lebender Menschen aus. Er erkundete penibel genau jede Gehirnwindung und deren Stimulierung. Seine Opfer stammten aus dem Beacon Mental Hospital. Einer Einrichtung, welche die Victorianos bereits Jahre zuvor mit Spenden unterstützt hatte. Das brachte Ruben eines Tages direkt in Kontakt mit Dr. Jimenez. Dr. Jimenez war, ungeachtet Rubens Gräueltaten, vor allem an den wissenschaftlichen Fortschritt und seinem eigenen Ansehen interessiert. Er veröffentlichte Rubens Erkenntnisse als seine eigenen. Diese wissenschaftlichen Abhandlungen brachten Dr. Jimenez die Aufmerksamkeit von Mobius ein, welche wiederum seine und Rubens Konstruktion von STEM finanzierten. Einem System mit dem Ruben eigentlich beabsichtigte als normaler, nicht entstellter Junge mit seiner Schwester vereint zu sein. Mobius war an dieser Art von STEM jedoch nicht interessiert. Weshalb sich mit der Zeit Spannungen zwischen der Organisation und Ruben bildeten. Die erste Version von STEM, die Ruben unter Mobius steigendem Druck konstruierte erforderte Kabel. Die Subjekte, deren Bewusstsein in der Maschine vereint werden sollten, ruhten in Badewannen vor der Maschine, samt eines Steckers im Genick. STEMs zweite Fassung funktionierte Kabellos. Sie war zudem auf Rubens Gehirnströme abgestimmt. Was es Mobius unmöglich machte, die Maschine für ihre Zwecke zu benutzen. Mobius begab sich daraufhin jedoch schlichtweg auf die Suche nach einem Menschen mit ähnlichem Gehirnstrommuster. Das war Leslie. Er hatte ein ähnliches Trauma durchlebt wie Ruben. Was ihn kompatibel machte. Mit Leslie als Druckmittel forderten sie von Ruben STEM abzuwandeln. Als der sich weigerte, töteten Mobius Leute Ruben. Sie hielten lediglich sein Gehirn am Leben, was sie als Kern von STEM benutzten. Aber Rubens Bewusstsein war zu stark. Es eroberte mit jedem Test mehr und mehr der STEM Welt. Als Mobius das klar wurde, war bereits alles zu spät. Ruben war bereits ein fester Bestandteil von STEM.
Dr. Jimenez hatte die meisten Gräueltaten mitangesehen. Aber als er Rubens Gehirn als Kern von STEM entdeckte, kamen auch ihm Zweifel. Doch da war es bereits zu spät. Die nächste Aktivierung zog Marcelo Jimenez ebenso in STEM wie Leslie und die Polizisten. Durch seine Rolle als Konstrukteur der Maschine, war Jimenez jedoch bewusst, dass Leslie ihre Karte in die Freiheit darstellte. Aber Dr. Jimenez Rettungsversuch schlug fehl. In dem Moment, wo Sebastian ihn erreichte und er alles erklärte, versetzte Ruben den Amalgam Alpha ins virtuelle STEM Labor. Der Fleischliche Zusammenschluss aller fehlgeschlagenen Testsubjekte STEMs zerquetschte Jimenez mit einem einzigen Prankenhieb. Selbiger Hieb trennte Sebastian von Leslie. Beide wurden erneut an einen anderen Ort von Ruviks Welt geschleudert.
Juli Kidman war die erste des Trios, die Leslie wieder erreichte. Sie eskortierte ihn durch die eingestürzte Stadt Richtung Beacon Momerial, denn da war der Ausgang. Doch in dem Moment, wo sie einen Spielplatz durchquerten, veränderte sich Julis Wahrnehmung. Leslies Gestalt fror ein und flimmerte wie das Bild eines Fernsehers. Die Silhouette wechselte im Sekundentakt zwischen Leslie und Ruvik. Juli wurde klar, dass es Zeit war Leslie zu beseitigen. Sie richtete ihre Pistole auf ihn. Doch ihr Unterbewusstsein machte Juli erneut einen Strich durch die Rechnung. Sie stritt sich mit dem Abbild ihres Chefs hinter sich. Tatsächlich war die Person hinter ihr aber Sebastian Castellanos. Er hatte Juli einige Minuten zuvor vorbeigehen sehen und umstellte sie nun gemeinsam mit Joseph. Als Juli sich zu Sebastian umdrehte, weil sie endlich seine Stimme, statt die ihres Chefs hörte, stürmte Joseph vor. Er wollte Leslie beschützen. Aber der Junge schrie und nahm reiß aus. Ausgelöst durch das panische Geräusch löste sich ein Schuss aus Julis Pistole. Er traf Joseph, der Leslies Stelle eingenommen hatte. Juli ignorierte ihren ehemaligen Kollegen. Sie stürmte Leslie hinterher, während Sebastian vom Erdboden verschlugen wurde.
Getrennt voneinander arbeiteten sich Sebastian und Juli zum Beacon Mental Hospital vor. In dessen Hinterhof Sebastian Leslie wiederentdeckte. Leslie schien wie ausgewechselt. Er stammelte nicht länger vor sich hin und schritt aufrecht durch die zweite Pforte des Hofs in den Leuchtturm-Trakt. Sebastian rannte ihm hinterher, aber wie üblich hinderte ihn Ruviks Traumwelt am Vorankommen. Gerade als er die Badewannen von STEM unterhalb des Leuchtturmlichts erreicht hatte, kam Leslie herein. Dicht gefolgt von Juli. Sebastian zog sofort seine Waffe, richtete sie auf Juli und stellte sich schützend vor Leslie. Juli Kidman versuchte ihn mit Worten zu beschwichtigen. Leslie durfte hier nicht existieren. Er war genau da wo Ruvik ihn haben wollte, bei STEM. Sebastian begriff die Situation zu spät. Der chirurgisch weiße Raum mit seinen Kabeln, Schläuchen und dem oben thronenden Licht, verwandelte sich in eine gelbrote Albtraumwelt, mit STEMs gigantischen Gehirn als Zentrum. Leslie schritt Ruvik entgegen, dessen Arme ihn willkommen hießen. Bevor Sebastian etwas unternehmen konnte, zerfiel Leslie unter Ruviks Berührung zu Wasser und floss in das gewaltige Gehirn.
Sebastians Welt rotierte. Plötzlich viel er in den Himmel Krimson Citys und stürzte auf ein gigantisches, vor Blut strotzendes Gehirn. Autos trieben durch die Luft und ein gewaltiges Monstrum aus Körperteilen trachtete ihm nach dem Leben. Sebastian kletterte auf die Ladefläche eines umherfliegenden Hum-Vees und begann mit dessen Maschinengewehr zurück zu schlagen. Unzählige Salven und Geschosse eines herum liegenden Raketenwerfers später, fand er den Schwachpunkt. Im Maul des Monstrums saß Ruvik. Mit seiner finalen Tat jagte Sebastian ihm eine Kugel in den Kopf. Damit endete dieser Albtraum. Immer noch mit STEM verbunden, stieg Sebastian aus der Wanne, riss Ruviks Gehirn aus der Maschine und zertrat es am Boden.
Juli hatte Mobius Indoktrinierung überwunden und sich des Abbilds ihres Chefs selbst entledigt. Sie kam als erste wieder zu sich. In Mobius realem STEM Labor, erblickte sie an sich das Mahl, was alle STEM Kandidaten zeichnete. Myra bat sie zum Debriefing zu kommen, während Leslie erwachte. Aber Juli hatte noch etwas zu erledigen. Sie täuschte Sebastians Tod vor und schützte ihn so vor Mobius Säuberungsmannschaft. Als das Team abgerückt war, stieg Sebastian aus der Wanne. Er schritt an den Leichen von Dr. Jimenez, Oscar und Joseph vorbei in Richtung Ausgang. Ein Sondereinsatzkommando stürmte an ihm vorbei in die Heilanstalt. Für sie waren lediglich 37 Minuten vergangen. Keiner von ihnen wusste von dem Horror, den Sebastian erlebt hatte. Für sie war es nur ein weiteres blutiges Schlachtfeld. Die Streifenpolizisten auf dem Vorhof ignorierten ihn ebenso wie Leslie. Der weißhaarige Junge spazierte unbehelligt zum Tor der Anstalt raus.
